上海生物商贸有限公司

什么是基因组重测序_基因组重测序的用途有哪些

大家好!小编今天给大家解答一下有关什么是基因组重测序,以及分享几个基因组重测序的用途有哪些对应的知识点,希望对各位有所帮助,不要忘了收藏本站喔。

动植物重测序--变异检测

针对目标性状,选择 表型极端差异的亲本 构建家系,对该家系 目标性状表型极端的子代 分别混合得到的两个样本池进行全基因组重测序,检测到的两池间DNA差异片段即为候选区域,可进一步定位到目标性状相关的基因或标记。

什么是基因组重测序_基因组重测序的用途有哪些-图1

GWAS(Genome-wide association study)是对遗传多样性丰富的自然群体的每个个体进行基因组测序,结合目标性状的表型数据,基于一定的统计方法进行全基因组关联分析,可以快速获得影响目标性状表型变异的染色体区段或基因位点。

基于521份不同玉米自交系品种的深度重测序数据进行SVs检测和群体多态性SV(pSV)分析。

华大把以上内容归到一个产品里,即动植物全基因组重测序,作为一个标准分析流程,该分析的内容都含有,其他的就要结合研究目的采用不同的取样、建库和测序策略了。

待测物种如果有发表过的参考基因组,重新进行测序就不需要拼接,可以直接对测序reads进行短序列比对。简而言之就是对基因组序列已知的物种个体进行基因组重新测序,本质就是找变异。

什么是基因组重测序_基因组重测序的用途有哪些-图2

生物信息分析中的测序概念

1、正义链 :DNA上携带有编码蛋白质氨基酸信息的核苷酸序列的链称为正义链; 反义链 :mRNA转录时结合的那条链称之为模板链,即碱基互补配对的那条链。

2、de novo测序也称为从头测序:其不需要任何现有的序列资料就可以对某个物种进行测序,利用生物信息学分析手段对序列进行拼接,组装,从而获得该物种的基因组图谱。获得一个物种的全基因组序列是加快对此物种了解的重要捷径。

3、denovo测序也称为从头测序:其不需要任何现有的序列资料就可以对某个物种进行测序,利用生物信息学分析手段对序列进行拼接,组装,从而获得该物种的基因组图谱。获得一个物种的全基因组序列是加快对此物种了解的重要捷径。

4、基因测序是一种新型的能够从血液或唾液中分析测定基因全序列的基因检测技术。基因测序是一种新型基因检测技术,能够从血液或唾液中分析测定基因全序列,预测罹患多种疾病的可能性,个体的行为特征及行为合理。

什么是基因组重测序_基因组重测序的用途有哪些-图3

5、测序是生物信息学的基础和主要数据来源,可以是人类数据也可以是其他的数据。

6、与基因密切联系的真正在幕后操纵生命的,是一个崭新的概念———核酸。现代遗传学家认为,基因是DNA(脱氧核糖核酸)分子上具有遗传效应的特定核苷酸序列的总称,是具有遗传效应的DNA分子片段。

全基因组重测序的概述

全基因组重测序是对已知基因组序列的物种进行不同个体的基因组测序,并在此基础上对个体或群体进行差异性分析。

全基因组重测序(WGS) :全基因组重测序是对已知基因组序列的物种进行不同个体的基因组测序,并在此基础上对个体或群体进行差异性分析。

全基因组测序是对未知基因组序列的物种进行个体的基因组测序。 1986年, Renato Dulbecco是最早提出人类基因组定序的科学家之一。他认为如果能够知道所有人类基因的序列,对於癌症的研究将会很有帮助。

全基因组重测序是对基因组序列已知的个体进行基因组测序,并在个体或群体水平上进行差异性分析的方法。随着基因组测序成本的不断降低,人类疾病的致病突变研究由外显子区域扩大到全基因组范围。

待测物种如果有发表过的参考基因组,重新进行测序就不需要拼接,可以直接对测序reads进行短序列比对。简而言之就是对基因组序列已知的物种个体进行基因组重新测序,本质就是找变异。

问题一:全基因组测序的技术路线 提取基因组DNA,然后随机打断,电泳回收所需长度的DNA片段(0.2~5Kb),加上接头, 进行基因簇cluster制备或电子扩增E-PCR,最后利用Paired-End(Solexa)或者Mate-Pair(SOLiD)的方法对插入片段进行测序。

基因组重测序有哪些步骤?每个步骤的目的是什么

因此,基因组应该指单倍体细胞中包括编码序列和非编码序列在内的全部DNA分子。说的更确切些,核基因组是单倍体细胞核内的全部 DNA分子。线粒体基因组则是一个线粒体所包含的全部DNA分子。

提取DNA后,构建文库,简要步骤如下: ① 限制性内切酶TaqI酶切; ② 连接P1接头; ③ DNA随机打断片断化; ④ 目的片段回收与末端修复; ⑤ 连接P2接头; ⑥ RAD片段富集; ⑦ 上机测序。

图1-1,以SOLiD为例,说明整个实验方案。双末端(Paired-End)测序原理测序深度(Sequencing Depth):测序得到的碱基总量(bp)与基因组大小(Genome)的比值,它是评价测序量的指标之一。

以上内容就是解答有关什么是基因组重测序的详细内容了,我相信这篇文章可以为您解决一些疑惑,有任何问题欢迎留言反馈,谢谢阅读。

分享:
扫描分享到社交APP
上一篇
下一篇
发表列表
请登录后评论...
游客 游客
此处应有掌声~
评论列表

还没有评论,快来说点什么吧~